TRANSCRIPTOME INSIGHT STUDIO

转录组一键分析从表达矩阵到生物学线索

差异表达、样本质控、免疫浸润、GO/KEGG富集与PPI互作,在一个可复核的分析工作台中完成。

上传自己的矩阵
01
表达矩阵在线分析当前可直接运行 · 数据仅在浏览器处理
02
FASTQ标准流程nf-core/rnaseq · 等待配置独立计算节点
当前差异模块用于快速初筛;正式结论请用 DESeq2/edgeR 复核。
QUALITY OVERVIEW

样本质量与整体结构

数据检查通过
有效基因80已合并重复基因名
样本数量82 个分组
候选差异基因23↑ 16↓ 7
免疫特征变化巨噬细胞Δ -1.706
PCA样本分布高变基因 · log₂(CPM+1)
Control_1Control_2Control_3Control_4Treat_1Treat_2Treat_3Treat_4PC1 94.4%PC2 2.0%
文库规模用于发现测序深度异常样本
Control_111,632
Control_211,681
Control_311,681
Control_411,731
Treat_115,426
Treat_215,278
Treat_315,506
Treat_415,617
自动摘要

当前比较为 Treatment 对 Control。在设定阈值下检出 23 个候选差异基因;免疫特征变化最明显的是 巨噬细胞。请结合PCA是否分离、组内重复是否聚集以及实验设计共同判断结果可靠性。

标准流程路线

从在线初筛到可发表分析

  1. 当前矩阵快速初筛浏览器本地计算
  2. 下一步DESeq2与批次校正独立R分析服务
  3. 扩展FASTQ全流程nf-core + 云端计算
  4. 复核可追溯报告参数、版本与日志